此时的长安城中，沈田子等将与王镇恶的矛盾越积越深。刘勃勃大举兴兵前来征讨关中，王镇恶则安排沈田子和傅弘之等人分守险要，然而并不派兵支援。

失去援兵支持的沈田子及傅弘之很快便丢失了阵地，无奈之下他们只得退回长安城。

“沈田子，你个败军之将还敢来见我，信不信我斩了你！”军营内，王镇恶对于沈田子的败仗很是不满。这时浑身血污的沈田子说道：“刘勃勃有雄兵十万，我等守备一座城池你只拨给我数千人马，这仗怎么打！”

王镇恶喝道：“你休要开脱责任，刘勃勃人马虽多但也只能用以野战，你有坚城守备有什么失败的理由？”

“坚城？真是可笑的坚城！之前我们挺入关中时，各处险要都破坏严重，此刻都还未修缮完毕，如何能称作坚城！王镇恶，我看你便是要借刘勃勃的手除掉我北府将士。”沈田子也咆哮着责问王镇恶。

这时王修带着刘义真走了进来，忙问道：“怎么啦，刘勃勃大兵在外，你们却在这将帅失和，这是何道理嘛。”王镇恶见是刘义真来了，忙说：“小公子，这沈田子目无法纪，战败仍不忘为自己开脱。”

“王老贼，你够了，明明是你想借刀杀人！”沈田子当下反驳。

见两人又要吵起来，王修赶忙出来调和，“现在不是互相推脱责任的时候，如今刘勃勃攻城拔寨很猛，咱们要是内部闹起来别人是会趁虚而入的。我看沈将军你也先回去，消消气，明日再行决意。”

沈田子瞪了王镇恶一眼拂袖离去，王镇恶则啐了一口：“什么东西，敢在我面前指手画脚。”王修见王镇恶这般跋扈，也只能摇摇头，离开了。

入夜，沈田子找到傅弘之，对他说道：“兄弟啊，王老贼是想借刘勃勃的刀杀我们啊。”傅弘之无奈道：“人为刀俎我为鱼肉，我们又能怎么办呢？”

沈田子诡异地笑道：“太尉临行前早有秘旨，告诫我们必要之时可以诛杀王镇恶，怎么样，你干不干。”傅弘之连连摆手道：“不可，不可，王镇恶身系坐镇关中的重任，你杀他等同谋反。”

沈田子轻蔑道：“愚兄你当初的胆色哪里去了，杀个王贼你还如此畏畏缩缩，我告诉你，今日他不死，日后便是我们死了！我沈田子反正是绝不会坐以待毙的，你若不愿助我就请此刻离去吧！”傅弘之见沈田子有些情绪失常，只能借机告辞了。

义熙十四年一月十五日，沈田子派人邀请王镇恶到傅弘之的军营里商议军事，王镇恶没有怀疑，就来到了傅弘之的军营。

沈田子的族人沈敬仁是一位非常骁勇的武士，沈田子请求众人回避，自己与王镇恶密谈，于是，命令沈敬仁在帐中将王镇恶斩杀。

沈田子杀死王镇恶以后，又在军中斩杀了王镇恶的哥哥王基、弟弟王鸿、王遵、王渊及王镇恶的堂弟王昭、王朗、王弘，共计七人，王镇恶死时46岁。

随后，沈田子又将最近关中传言“王镇恶要杀光军中江南人，据关自守”的消息大肆传播，以此证明自己杀王镇恶的必要性。而傅弘之得知沈田子诛杀王镇恶的消息后，大惊失色，赶忙像王修及时汇报了这一消息。

沈田子处理好一些收尾工作后，便带着数十人逃回长安，声言王镇恶要谋反，王修下令将沈田子逮捕，斥责他擅自诛杀大将之罪，将其斩杀于长安稾仓门外，沈田子死时36岁。

于是，刘义真以冠军将军毛修之接替王镇恶为安西将军司马，负责指挥整个关中晋军。

不久之后，刘义真身边的群小又像刘义真进谗言说：“王镇恶想要谋反，因此，沈田子将他诛杀，而王修是关中人，又诛杀了沈田子，这说明王修也是想要谋反。”

刘义真听信了谗言，就命令身边的亲随刘乞等人诛杀了王修。王修一死，驻守关中各地的晋军将士们都是一片恐慌，没有一个统一的领导人了，关中百姓也开始对晋军失去信心。

为了自保，刘义真下令将长安附近各地的守军全部撤回到长安城内，关闭城门固守长安孤城，晋军撤离以后，长安附近各个郡县全都投降了夏国。

赫连勃勃的儿子赫连璝率军夜袭长安，没有得手，而赫连勃勃本人则率领夏军进驻到了长安附近的咸阳，长安城内居民出外砍柴的道路，都被夏军切断了。

关中局势的陡然变故让身处建康大后方的刘裕大为震惊，他急忙命蒯恩，朱超石，朱龄石等将一同北上增援。

然而，这一次上天好像故意和刘裕作对似的，派去的精兵强将最终都死于关中之乱中